1987年奉教育部令正式招生，聘請廖峰正教授擔任校長。 1991年更名為“私立高苑工商專科學校”。 1995年成立進修專校。 1998年八月奉教育部核定改制為“高苑技術學院”，大學部二年制技術系開始招生，並附設專科部及進修專校。 1999年四年制技術係正式招生。 2000年八月進修專校改制為進修學院附設專科部。 2002年八月增設經營管理研究所。 2004年八月增設高分子環保材料研究所。 2005年八月教育部准予改名“高苑科技大學”。 2006年新設電子工程研究所，電機工程研究所，機械與自動化工程研究所，路工技術研究所及建築研究所。 2007年八月路工技術研究所更名為土木工程研究所，高分子環保材料研究所更名為化工與生化工程研究所，生化工程系更名為化工與生化工程系，財務金融系更名為國際商務系。 2008年八月成立資訊學院，增設資訊科技應用研究所，資訊科技系，行銷與流通管理系，光電科學與工程系。 2009年八月奉教育部核定增設休閒運動管理系。 2010年八月奉教育部核定增設化工與生化工程系材料技術組，化工與生化工程系應用生物技術組與綠色能源科技系。 2011年八月奉教育部核定增設扣件產業技術整合學位學程（研究所），機械與自動化工程系先進車輛組及建築系建築設計組（改名）
2010年6月25日 奉教育部核定聘請曾燦燈教授擔任校長。
奉教育部核定增設化工與生化工程系材料技術組，化工與生化工程系應用生物技術組與綠色能源科技系。
高苑科技大學為全台灣第一座落高雄科學園區的世紀學府，其前身是1986年創建籌設的“私立高苑工業學校”。於1986年創立 ，簡稱高苑科大，位於高雄科學園區，有設計學院、機電學院、商業暨管理學院、資訊學院等四個學院、八個研究所、十四個科系。大致相當於大陸一般二本。
