| 農學院 | 生物資源研究所（博士班） | 生物科技系（含碩士班） |
|---|---|---|
| 食品科學系（含碩士班、博士班、進修部） | 農園生產系（含碩士班、博士班） | |
| 森林系（含碩士班） | 水產養殖系（含碩士班、博士班） | |
| 動物科學與畜產系（含碩士班） | 植物醫學系（含碩士班） | |
| 木材科學與設計系（含碩士班） | 食品生技碩士學位學程在職專班(擬於2021年停招) | |
| 食品安全管理研究所（碩士班） | 科技農業學士學位學程食品科學系科技農業組 |
| 工學院 | 生物機電工程系（含碩士班、進修部） | 材料工程研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 環境工程與科學系（含碩士班、博士班） | 機械工程系（含碩士班） | |
| 土木工程系（含碩士班、博士班） | 水土保持系（含碩士班） | |
| 車輛工程系（含碩士班） | 環境資源與防災學位學程（含進修部）(擬於2021年停招) | |
| 先進材料學士學位學程 |
| 管理學院 | 景觀暨遊憩管理研究所（碩士班） | 財務金融研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 科技管理研究所（碩士班）(將於2020年停招) | 農企業管理系（含碩士班） | |
| 資訊管理系（含碩士班） | 工業管理系（含碩士班） | |
| 企業管理系（含碩士班）(擬於2021年停招進修部) | 時尚設計與管理系（含碩士班） | |
| 餐旅管理系（含碩士班） | 高階經營管理碩士在職專班 | |
| 財務金融國際學士學位學程 |
| 人文暨社會科學學院 | 技術及職業教育研究所（碩士班） | 客家文化產業研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 社會工作系（含碩士班、進修部） | 應用外語系（含碩士班） | |
| 休閒運動健康系（含碩士班、進修部） | 幼兒保育系（含碩士班） | |
| 師資培育中心 | 通識教育中心 |
| 國際學院 | 熱帶農業暨國際合作系（含碩士班、博士班） | 食品科學國際碩士學位學程 |
|---|---|---|
| 土壤與水工程國際碩士學位學程 | 農企業管理國際碩士學位學程 | |
| 觀賞魚科技及水生動物健康國際學位專班 | 動物用疫苗國際學位專班 |
| 獸醫學院 | 獸醫學系（含碩士班、博士班） | 動物疫苗科技研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 野生動物保育研究所（碩士班） |
| 研究單位 | 動物製劑試量產測試中心 | 動物製劑研究中心 |
|---|---|---|
| 客家產業研究中心 | 生物多樣性研究中心 | |
| 災害防救科技研究中心 | 保育類野生動物收容中心 | |
| 實驗動物中心 | 工作犬訓練中心 | |
| 食品安全中心 | 綠建材技術服務中心 |
| 附設單位 | 幼兒園 | 農場 |
|---|---|---|
| 達仁林場 | 保力林場 | |
| 畜牧場 | 園藝場 | |
| 水產養殖場 | 獸醫教學醫院 | |
| 食品加工廠 | 木材加工廠 | |
| 水工實驗場 | 機械工廠 | |
| 農機具陳列館 | 農業機械訓練中心 | |
| 動物疾病診斷中心 | 車輛工廠 |
| 行政單位 | 校長室 | 學術副校長室 |
|---|---|---|
| 行政副校長室 | 教育副校長室 | |
| 教務處 | 學生事務處 | |
| 推廣教育處 | 職涯發展處 | |
| 跨領域特色發展中心 | 總務處 | |
| 研究發展處 | 國際事務處 | |
| 秘書室 | 人事室 | |
| 主計室 | 體育室 | |
| 圖書與會展館 | 電子計算機中心 | |
| 環境保護暨安全衛生中心 | 語言中心 | |
| 研究總中心 |
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