現行學術單位如下：
| 工學院 | 工學院工程科技博士班 | 化學工程與材料工程系（學、碩、碩在職、博） |
土木工程系（五專、學、碩、碩在職、博）
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|---|---|---|---|
| 營建工程系（學、碩、碩在職） | 機械工程系（學、碩、碩在職、博） | 工業工程與管理系（學、碩、碩在職、博） | |
環境與安全衛生工程系（學、碩、碩在職）
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工業設計系（學、碩） |
模具工程系（五專、學、碩、碩在職、博）
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機電工程系（學、碩、碩在職）
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| 電機與資訊學院 |
電機工程系（學、碩、碩在職、博）
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電子工程系（學、碩、碩在職、博）
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電腦與通訊工程系（學、碩、碩在職） |
|---|---|---|---|
| 資訊工程系（學、碩、碩在職） | 光電工程研究所 | 半導體工程系（學、碩、碩在職） |
| 海事學院 | 海事學院海事科技產學合作博士班 | 造船及海洋工程系（學、碩、碩在職） | 輪機工程系（五專、二技、學、碩、碩在職） |
|---|---|---|---|
| 海事資訊科技系（學、碩、碩在職） | 航運技術系（五專、二技、學、碩、碩在職） | 海事風電工程碩士學位學程 | |
| 電訊工程系（學、碩、碩在職） |
| 水圈學院 | 水圈學院水產科技產業博士班 | 漁業生產與管理系（學、碩、碩在職、五專） | 水產食品科學系（學、碩、碩在職） |
|---|---|---|---|
| 水產養殖系（學、碩） | 海洋生物技術系（學、碩） | 海洋環境工程系（學、碩） |
| 管理學院(第一校區) | 管理學院博士班 | 高階主管經營管理碩士在職專班(EMBA) | 國際管理碩士學位學程(IMBA) |
|---|---|---|---|
| 科技法律研究所（碩、碩在職） | 創業管理碩士學位學程 | 風險管理與保險系（學、碩、碩在職） | |
運籌管理系（學、碩、碩在職）
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行銷與流通管理系（學、碩、碩在職）
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資訊管理系（學、碩、碩在職）
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| 管理學院(燕巢校區) |
企業管理系（學、碩、碩在職）
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國際企業系（學、碩、碩在職、博） |
| 財務金融學院 | 財融金融學院博士班 | 資訊財務碩士學位學程 | 金融系（學、碩、碩在職） |
|---|---|---|---|
| 財務管理系（學、碩、碩在職） |
| 商業智慧學院 |
會計資訊系（學、碩、碩在職）
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財政稅務系（學、碩、碩在職） | 智慧商務系（學、碩、碩在職） |
|---|---|---|---|
觀光管理系
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金融資訊系（學、碩、碩在職） |
| 海洋商務學院 | 海洋事務與產業管理研究所（碩） | 航運管理系（學、碩、碩在職、博） | 海洋休閒管理系（學、碩） |
|---|---|---|---|
| 商務資訊應用系（學、碩、碩在職） | 供應鏈管理系（學、碩、碩在職） |
| 人文社會學院 | 文化創意產業系（學、碩、碩在職） | 人力資源發展系（學、碩、碩在職） |
|---|
| 外語學院 |
應用英語系（第一校區）
應用英語系（燕巢校區應外組）
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應用日語系（學、碩、碩在職） | 應用德語系（學、碩） |
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| 共同教育學院 | 博雅教育中心 | 基礎教育中心 | 外語教育中心 |
|---|---|---|---|
| 藝術文化中心 |
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