| 医学院 |
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|---|---|---|
| 医学系 | 医学科学研究所博士班 | |
| 转译医学博士学位学程 | ||
| 医学系药理暨毒理学硕士班/博士班 | ||
| 医学系生理医学硕士班 | ||
| 医学系微生物及免疫学硕士班 | ||
| 医学系生物化学硕士班 | ||
| 护理学系 | 护理学系硕士班 | |
| 公共卫生学系 | 公共卫生学系硕士班 | |
| 医学检验生物技术学系 | 医学检验生物技术学系医学生物技术硕士班 | |
| 医学资讯学系 | 医学资讯学系硕士班 | |
| 物理治疗学系 | 物理治疗学系硕士班 | |
| 学士后中医学系 | ||
| 生命科学系 | 生命科学系硕士班 | |
| 分子生物暨人类遗传学系 | 分子生物暨人类遗传学系硕士班 |
| 教育传播学院 |
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|---|---|---|
| 传播学系 | 传播学系暨硕士班 | |
| 儿童发展与家庭教育学系 | 教育研究所 | |
| 师资培育中心 | ||
| 媒体制作暨教学中心 | ||
| 通识教育中心 | ||
| 体育教学中心 |
| 国际暨跨领域学院 |
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|---|---|---|
| 英语教学中心 | 华语中心 | |
| 人文社会学院 |
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| 社会工作学系 | 社会工作学系硕士班 | |
| 人类发展与心理学系 | 人类发展与心理学系硕士班 | |
| 东方语文学系 | 东方语文学系硕士班 | |
| 英美语文学系 | 宗教与人文研究所 |
慈大虽由佛教慈善团体创立，但教职员生仍享有宪法第十三条所保障之宗教自由[3]，学生社团亦有圣经真理生命社、儒学社、触爱团契等，现全校绝大多数皆非慈济人。
目前共有6个大类：“学生自治组织”、“学术、艺术性”、“服务性”、“音乐性”、“联谊性”、“体育性”，2010年底共计56个学生社团，其中不乏表现优异者。（仅计入日间部登记在案者，不含校队、进修部、各系学会下属校队社团）。
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