| 農學院 | 生物資源研究所（博士班） | 生物科技系（含碩士班） |
|---|---|---|
| 食品科學系（含碩士班、博士班） | 農園生產系（含碩士班、博士班） | |
| 森林系（含碩士班） | 水產養殖系（含碩士班、博士班） | |
| 動物科學與畜產系（含碩士班） | 植物醫學系（含碩士班） | |
| 木材科學與設計系（含碩士班） | 食品生技碩士學位學程在職專班 | |
| 食品安全管理研究所（碩士班） | 科技農業學士學位學程食品科學系科技農業組 |
| 工學院 | 生物機電工程系（含碩士班） | 材料工程研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 環境工程與科學系（含碩士班、博士班） | 機械工程系（含碩士班） | |
| 土木工程系（含碩士班、博士班） | 水土保持系（含碩士班） | |
| 車輛工程系（含碩士班） | 環境資源與防災學位學程 | |
| 先進材料學士學位學程 | 水資源教育及研究中心 | |
| 新興污染物研究中心 |
| 管理學院 | 景觀暨遊憩管理研究所（碩士班） | 財務金融研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 科技管理研究所（碩士班） | 農企業管理系（含碩士班） | |
| 資訊管理系（含碩士班） | 工業管理系（含碩士班） | |
| 企業管理系（含碩士班） | 時尚設計與管理系（含碩士班） | |
| 餐旅管理系（含碩士班） | 高階經營管理碩士在職專班 | |
| 財務金融國際學士學位學程 |
| 人文暨社會科學學院 | 技術及職業教育研究所（碩士班） | 客家文化產業研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 社會工作系（含碩士班） | 應用外語系（含碩士班） | |
| 休閒運動健康系（含碩士班） | 幼兒保育系（含碩士班） | |
| 師資培育中心 | 通識教育中心 |
| 國際學院 | 熱帶農業暨國際合作系（含碩士班、博士班） | 食品科學國際碩士學位學程 |
|---|---|---|
| 土壤與水工程國際碩士學位學程 | 農企業管理國際碩士學位學程 | |
| 華語文中心 | 觀賞魚科技國際學位專班 | |
| 動物用疫苗國際學位專班 |
| 獸醫學院 | 獸醫學系（含碩士班、博士班） | 動物疫苗科技研究所（碩士班） |
|---|---|---|
| 野生動物保育研究所（碩士班） |
| 進修部 | 食品科學系 | 社會工作系 |
|---|---|---|
| 休閒運動健康系 | 休閒運動健康系 | |
| 生物機電工程系 | 環境資源與防災學位學程 | |
| 企業管理系 |
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