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學校有醫學院、口腔醫學院、醫學科技學院、健康管理學院、醫學人文暨社會學院、護理學院共六個學院，其附設醫院也分為大慶院區、中港院區、太原院區以及文心院區（口腔醫學研究中心）四大院區，其中大慶院區規模最大並緊鄰校本部，為台中市三大醫學中心之一。學校有兩大校區——校本部以及大慶校區。

校本部位於建國北路一段與文心南路交叉口，主要建築有行政中心、圖書館、實驗大樓、張不大樓、研究大樓、學人樓以及杏樓，西側緊鄰附設醫院大慶院區以及口腔醫學研究中心。

大慶校區於2004年啟用，位於大慶街上，近大慶車站，主要建築有A棟教室、B棟教室、C棟教室（大禮堂）以及學生活動中心（社團辦公室），東側與學校體育場相通。醫學人文暨社會學院 臺灣語文學系(102學年度停招) 

健康管理學院 應用外國語言學系  醫療產業科技管理學系  醫學應用化學系  公共衛生學系  職業安全衛生學系  營養學系  醫學資訊學系  健康產業科技管理學系(原健康餐飲暨產業管理學系) 

醫學科技學院 心理學系  生物醫學科學學系  物理治療學系  職能治療學系  語言治療與聽力學系  醫學檢驗暨生物技術學系  醫學影像暨放射科學系  視光學系 

醫學院 醫學系  護理學系  醫學社會暨社會工作學系 

口腔醫學院 牙醫學系