民國89年,升格為「中州技術學院」,學校發展為商學、工學、環設三學院。民國96年推動學校行政力求制度化,教學與研究力求卓越化,又與企業進行策略聯盟、產學合作,提供師生從事實務研究及實習之機會。民國98年獲得教育部獎勵大學教學卓越計畫經費補助,名列教學卓越大學。民國100年改名為「中州科技大學」。學校發展調整為工、管理、健康三學院,並增設保健食品研發暨檢驗中心、綠色產業技術研發中心、中小企業診斷與行銷中心三個中心,確立以產業技術、服務管理、健康產業為教學研究多元發展之重點與特色,以利學校永續經營與發展,並為國家培育具實務能力和人文素養的優質技職人才之目標。2012年3月29日:柴洵清董事長卸任,改由柴御清博士接任董事長。同年4月,黃政傑校長卸任,董事會敦聘曾慶瀛博士接任校長,副校長陳彥佑。同年8月,資訊工程系取消分組並改名多媒體與遊戲發展科學系。工程技術研究所改名機械與自動化工程系工程技術碩士班。停招餐飲廚藝科。
2013年8月:增設餐旅事業管理系。
2017年:幼兒保育系改名幼兒保育與家庭服務系。
2017年7月:曾慶瀛校長退休,由副校長陳彥佑代理校長。
2018年5月:由逢甲大學特聘教授、前臺中快捷巴士總經理黃思倫博士接任校長;增設行銷與流通管理系、時尚創意設計與管理系二技進修部。
2018年9月:陳芳益先生接任董事長。
以「麒麟花」意象與「中」、「CCUT」字形為基本型態,從原有校徽延伸設計以表現傳承概念,亦有書卷從中向外開展之意。
形態上具有循環性、動感、精緻比例或對稱之造型,呈現校訓「精公誠毅」之內涵。整體而言,以人形為中心,表達教育以人為本的想法,中州將以全體師生為核心,承先啟後邁向優秀之科技大學發展。
以活潑流暢線條呈現年輕、快樂、學習、希望,向上之形態強調追求卓越之目標,設計形態兼顧工、管理與健康三學院之形象,表達培育科技與人文並重之實用專業人才。
動感與永續循環之太極造型,有環環相扣無窮盡、生生不息之意,代表中州重視學生、教師與學校之關係,並與社會建立密切互動性的象徵。
整體標誌呈現三度空間之立體感,顯現本校具跨越時空與世紀之國際視野與發展。