| 任期 | 姓名 | 任職日期 | 離職日期 | 備註 |
|---|---|---|---|---|
| 01 | 王仁宏 | 2000年 | 2004年 | 首任 |
| 02 | 黃英忠 | 2004年 | 2008年 | 第一任 |
| 03 | 黃英忠 | 2008年 | 2012年 | 連任；第二任 |
| 04 | 黃肇瑞 | 2012年 | 2016年 | |
| 05 | 王學亮 | 2016年 | 2020年 | |
| 代理 | 莊寶鵰 | 2020年8月 | 2020年11月 | 時任學術副校長代理 |
| 06 | 陳月端 | 2020年11月 | 現任；首位女校長 |
| 公立學校 | 世界排名 | 全國排名 |
|---|---|---|
| 國立高雄大學 | 501+ | 30 |
| 公立學校 | 世界排名 | 全國排名 |
|---|---|---|
| 國立高雄大學 | 1201+ |
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