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教學單位

工程學院

本院於86學年度成立，前身為「國立雲林技術學院」工程學群，機械工程、電機工程、電子工程、環境與安全系為最初的科系。本院目前共有7系11所5博士班及4中心，工程學院已獲得IEET國際工程與科技教育認證。^[28][29]

管理學院

管理學院於民國86年(1997年)設立，設有三大管院總面積約22594平方公尺，除注重大學部教育外，也兼顧發展研究所教育，每一系皆設有博士班、碩士班，為台灣第一個獲得美國AACSB國際商管認證與台灣ACCSB華文學院商管認證雙重認證之科技大學。